Sonraki birkaç yıl içersinde Jack, Call'dan viski üretimi hakkındaki her şeyi öğrendi. Daha sonra, 1863 yılının Eylül ayında, alkollü içki satmak yerine insan ruhunu yüceltme arzusunun artan baskısına dayanamayan Call, viski imalathanesini o sırada 13 yaşında olan Jack'a sattı.Jack Daniel da tıpkı Dan Call gibi taze viskinin akçaağaç kömürüyle damıtılarak yumuşatılmasını gerektiğine inanıyordu. Aslında bu işlem sıkça kullanılmakta olmasına rağmen, zaman ve maliyet açısından getirdiği yük nedeniyle cimri viski üreticileri tarafından giderek daha az kullanılmaya başlandı. Ancak Bay Jack, vazgeçilmez olduğuna inandığı kömürde yumuşatma işlemini geliştirerek 1866 yılında kusursuz hale getirdi. Bugün de, Jack Daniel's viskisine yumuşak özelliğini ve benzersiz tadını kömürde yumuşatma işlemi vermektedir. Hükümetin vergi koyacağını tahmin eden Bay Jack, 1866 yılında damıtımevini yasal olarak tescil ettirdi. Kendisi bu işlemi yaptıran ilk üreticiydi. Böylece damıtımevi de ülkenin en eski kayıtlı damıtımevi sıfatını kazandı.1904 yılında Jack, Old No. 7 Tennessee Viskisiyle St. Louis, Missouri'de yapılan Dünya Fuarı'na katıldı. Dünyanın her tarafından katılan 20 viski arasından sadece onun viskisi Altın Madalya ile ödüllendirildi ve dünyanın en iyi viskisi olarak onurlandırıldı.Evlenmeyen ve hiç çocuğu olmayan Jack Daniel, damıtımevini yeğeni Lem Motlow'a bıraktı. Motlow, damıtımevinin içki yasağı yıllarında da ayakta kalmasını sağladı.

Yumuşatma:
Odun kömürde ile tavlandirma, Jack Daniel's gibi Tennessee viskisi yapımında kullanılan bir işlemdir. İşlem, yeni yapılan viskinin yaklaşık 3 metrelik akçaağaç kömürüyle sımsıkı kaplanmış dev konteynerlerden yavaşça damlatılmasını içermektedir. 10 gün süren bu işlemin sonunda, viski kömür özünü emer ve içki, rafine hale gelerek benzersiz bir tat ve kokuya sahip olur.

Alkolün Uçması:
Viski yıllanırken, viski fıçıları "nefes alır". Bu olay nedeniyle, ilk yılda alkol hacminin yaklaşık olarak yüzde sekiz ile on arasındaki bir kısmı buharlaşarak havaya karışır. Buharlaşma daha sonraki yıllarda fıçı başına yüzde dört ile beş arasında değişen bir oranda devam eder. İyi bir viski, şişelenmeye hazır oluncaya dek geçen sürede ilk hacminin büyük bir olasılıkla yaklaşık olarak yüzde otuzunu kaybeder.